界各地考古挖掘，并在死海湖底发现朗基努斯之枪，之后不久，葛城博士提出了一种理论，即s2理论，又名“超级螺旋管理论”理论基础是dna这样的螺旋状可以提供无尽的能量。

    2000年，为了验证s2理论，葛成团队前往南极，着手进行s2机关的开发，9月4日朗基努斯之枪被带往南极。

    9月10日，对“亚当”进行调查，但队伍中还有seele组织的碇源堂和基路议长。

    9月12日二人中途离开回到日本，并带走了研究数据，他们早就知道了第二天与亚当“接触实验”会发生什么。

    9月13日“接触实验”造成了第二次冲击，葛城团队尝试用朗基努斯之枪封印住亚当，最终失败了，葛成博士将自己的女儿葛城美里放进救生舱，自己和其他人死在了冲击之下，葛城美里后来患上了失语症。

    冲击之下，亚当分崩离析，灵魂也从体内飞出，之后灵魂被seele回收并赋予肉身，于是就有了渚熏。

    南极大陆也就此消失，水平面上升数十米，地球自转轴偏离，灾害不断，死海文书的部分内容再次得到了验证。

    2003年，在死海文书的提示下，seele在日本箱根地区发现了另一个巨大地洞，nerv组织总部就在洞中建设。

    同时也开启了使徒（Angel）对人类的战争。

    使徒是亚当的衍生生命体，其目标是与亚当融合以触发“第三次冲击”，从而重置世界。

    核心冲突：使徒战争与NERV的使命人类为对抗使徒，成立了联合国下属的NERV组织，研发巨型生物兵器EVA（Evangelion）。

    EVA并非纯机械，而是以亚当或莉莉丝为原型制造的“人造使徒”，需由14岁少年少女（适格者）通过神经同步驾驶。

    其核心设定包括：1.A.T.力场（绝对领域）：使徒与EVA共有的防御屏障，象征个体间的“心之壁”。

    人类